Quando una leggenda finisce, ne inizia un'altra... I destini intrecciati di tre personaggi di Zemuria si decideranno in questo capitolo culminante della serie The Legend of Heroes Seguite le orme dell'eroe di guerra Rean Schwarzer, del liberatore Lloyd Bannings e del misterioso uomo mascherato C e alternate liberamente le avventure da uno all'altro grazie al sistema Crossroads. Lloyd Bannings, capo della Sezione di Supporto Speciale del Dipartimento di Polizia di Crossbell, deve lottare ancora una volta per la libertà della sua città dopo che i festeggiamenti per l'indipendenza di Crossbell sono interrotti dall'improvvisa ricomparsa di una vecchia minaccia. Dopo gli eventi del Grande Crepuscolo, l'eroe di Erebonia Rean Schwarzer e i suoi studenti tornano alla vita normale nel secondo campus della Thors Academy. Tuttavia, questa pace effimera viene interrotta dall'emergere di una nuova minaccia.